282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004055 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  95.45 
 
 		 220 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  66.82 
 
 		 220 aa  317  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  40.76 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  40.28 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  42.36 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  41.86 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  40.47 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  37.32 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  37.32 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  37.04 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  39.42 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  39.13 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  42.79 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  36.45 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  36.27 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  37.2 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  34.13 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  36.71 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  40.38 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  36.97 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  35.94 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.81 
 
 		 231 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  37.14 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  34.62 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  35.85 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  36.02 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  33.81 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 		 222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  36.02 
 
 		 224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  35.38 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  37.19 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  36.06 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  32.86 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  32.86 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  34.31 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  37.5 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  35.12 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  36.41 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  34.29 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  32.86 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  32.37 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  32.2 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  33.82 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  38.69 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  34.76 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  34.67 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  33.78 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  33.01 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0375  K+ transporter  31.94 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.506643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  35.11 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  34.95 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  35.52 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  33.83 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  36.02 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  35.11 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  35.38 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  38.12 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  35.82 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  38.65 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  33.5 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  33.5 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  33.5 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  35.85 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  40.14 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  36.81 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  36.81 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  30.43 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  36.81 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  33.01 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  27.91 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  31.48 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  32 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  32.66 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  34.15 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  34.26 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>