234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0952 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  63.43 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  53.95 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  43.93 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  43.46 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  43.32 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  40.19 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  41.86 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  44.39 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  39.34 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  38.79 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  38.79 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  40.89 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  38.32 
 
 		 231 aa  161  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  36.74 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40.85 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  39.41 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  36.45 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  40.65 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  37.85 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  37.85 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  36.28 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  32.71 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  38.99 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  41.45 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  37.38 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  36.92 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  38.05 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  38.05 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  36.28 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  42.03 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  37.56 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  37.56 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  36.79 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  37.09 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  34.91 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  36.62 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  35.62 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  33.33 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  36.45 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  33.8 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  33.82 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  36.26 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  33.97 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  35.21 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  32.87 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  32.87 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  37.06 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  32.71 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  33.02 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  33.33 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  33.49 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  33.49 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  38.69 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  34.98 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  31.13 
 
 		 224 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  33.33 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  36.52 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  34.16 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  36.52 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  35.75 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  32.23 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  35.56 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  39.47 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  30.09 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  34.09 
 
 		 223 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  35.57 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  37.22 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  36.67 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  29.52 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  33.52 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  30.81 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  32.78 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  34.59 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  33.7 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>