More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2087 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  96.4 
 
 
222 aa  431  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  58.37 
 
 
223 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  43.06 
 
 
220 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  46.3 
 
 
233 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  42.25 
 
 
215 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  43.26 
 
 
217 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  42.92 
 
 
215 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  42.25 
 
 
227 aa  185  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.86 
 
 
221 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.86 
 
 
221 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  42.52 
 
 
220 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  44.34 
 
 
231 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  41.15 
 
 
217 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  40.76 
 
 
221 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  40.28 
 
 
217 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  43.87 
 
 
231 aa  176  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  39.81 
 
 
221 aa  174  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  38.97 
 
 
217 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  39.81 
 
 
221 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  39.52 
 
 
219 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  39.55 
 
 
232 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  38.1 
 
 
220 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  38.1 
 
 
220 aa  169  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  41.04 
 
 
229 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  41.04 
 
 
229 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  44.12 
 
 
219 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  42.92 
 
 
231 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  42.27 
 
 
227 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  43.33 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  41.04 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
233 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  43.78 
 
 
220 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  35.65 
 
 
219 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  37.26 
 
 
216 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  40.74 
 
 
224 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  44.08 
 
 
224 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  42.13 
 
 
220 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  39.91 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  38.57 
 
 
222 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  36.15 
 
 
221 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  40.37 
 
 
224 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  40.48 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  39.15 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 
222 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  41.63 
 
 
225 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  35.14 
 
 
244 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 
217 aa  141  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 
217 aa  141  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  41.63 
 
 
228 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  38.28 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  41.15 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 
218 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  36.73 
 
 
224 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  40.76 
 
 
224 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  38.25 
 
 
234 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  36.02 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  39.25 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  36.02 
 
 
217 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  35.27 
 
 
234 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  35.27 
 
 
234 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  35.02 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  30.62 
 
 
217 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  35.48 
 
 
234 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  40.3 
 
 
225 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00941  VIC family potassium channel protein  35.32 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  34.56 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  37.56 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  35.27 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  32.55 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  33.97 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  35.48 
 
 
234 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  35.07 
 
 
217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  36.06 
 
 
230 aa  128  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  30.33 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  35.91 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  33.01 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
218 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  31.94 
 
 
218 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  34.55 
 
 
221 aa  124  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 
230 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  36.57 
 
 
221 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  30.63 
 
 
233 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  33.02 
 
 
217 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  35.78 
 
 
229 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>