247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0523 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  74.18 
 
 
222 aa  323  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  64.32 
 
 
220 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  60.38 
 
 
222 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  58.69 
 
 
220 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  58.02 
 
 
224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  54.29 
 
 
213 aa  242  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  51.83 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  53.27 
 
 
225 aa  228  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  51.39 
 
 
221 aa  227  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  50.23 
 
 
228 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  50.46 
 
 
228 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  51.2 
 
 
224 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  50 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  51.17 
 
 
232 aa  218  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  50.45 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  49.55 
 
 
230 aa  215  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  51.42 
 
 
235 aa  214  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  47.11 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  48.21 
 
 
224 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  51.42 
 
 
225 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  44.98 
 
 
230 aa  199  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  45.02 
 
 
231 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  45 
 
 
222 aa  191  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  43.46 
 
 
221 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  42.99 
 
 
221 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  45.45 
 
 
222 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  41.71 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  43.38 
 
 
222 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  42.11 
 
 
217 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  46.05 
 
 
229 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40.74 
 
 
220 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  42.18 
 
 
215 aa  169  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  38.97 
 
 
220 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  40.19 
 
 
215 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  40.09 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  41.31 
 
 
221 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  41.31 
 
 
221 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  43.33 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  40.85 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  43.81 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  40.67 
 
 
223 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  38.79 
 
 
227 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  37.21 
 
 
220 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  37.21 
 
 
220 aa  159  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  36.74 
 
 
219 aa  158  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  39.72 
 
 
217 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  37.04 
 
 
217 aa  148  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  37.74 
 
 
221 aa  148  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  35.87 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  40.49 
 
 
221 aa  144  9e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  35.85 
 
 
222 aa  138  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  35.05 
 
 
218 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  35.38 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  34.48 
 
 
219 aa  134  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  37.69 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 
218 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  33.33 
 
 
218 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  35.21 
 
 
216 aa  132  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
216 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  36.11 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  39.17 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  36.45 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  38.68 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  36.06 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  34.39 
 
 
229 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  37.32 
 
 
217 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.49 
 
 
231 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  34.39 
 
 
229 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  35.1 
 
 
220 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  35.21 
 
 
217 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  33.94 
 
 
250 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  33.78 
 
 
233 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
225 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  32.84 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  36.57 
 
 
221 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  34.29 
 
 
218 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 
217 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  36.59 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  36.31 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  33.03 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  33.17 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  30.97 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  32.09 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  29.77 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  29.13 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  29.77 
 
 
234 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  29.11 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  29.77 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>