268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0139 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  40.83 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  40.37 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.5 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.5 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  37.96 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  38.25 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  37.09 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  38.6 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  35.19 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  38.28 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  36.28 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  36.92 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  39.05 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  32.09 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  38.39 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  37.79 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  35.05 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  36.49 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  33.49 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  36.49 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  34.74 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  32.72 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  37.56 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  33.81 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  38.36 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  37.09 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  31.65 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  35.48 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3603  TrkA domain-containing protein  36.2 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  33.02 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  35.55 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  33.18 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  35.38 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.95 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  35.85 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  33.95 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  32.86 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  32.09 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  35.21 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  32.38 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  36.15 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  34.6 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  32.57 
 
 		 250 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  34.12 
 
 		 213 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  32.09 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  30.8 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  31.6 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  35.48 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  32.68 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  33.5 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  27.56 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  30.19 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  34.12 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  34.76 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  32.29 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  30.37 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  31.28 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  32.56 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  28.12 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  32.39 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  30.37 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  37.85 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  32.46 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000827601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  30.88 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000156349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  28.15 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>