More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0372 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  85.59 
 
 
222 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  50.68 
 
 
224 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  48.57 
 
 
231 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  48.11 
 
 
230 aa  204  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  45.66 
 
 
222 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  49.76 
 
 
224 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  44.29 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  47.22 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  48.4 
 
 
228 aa  198  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  46.98 
 
 
225 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  45.98 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  48.39 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  47.87 
 
 
224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  49.77 
 
 
225 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  46.76 
 
 
235 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  45.24 
 
 
230 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  47.87 
 
 
220 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  45.02 
 
 
222 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  45.33 
 
 
254 aa  188  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  45.45 
 
 
223 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  46.7 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  45.93 
 
 
213 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  46.45 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  39.45 
 
 
220 aa  168  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  41.9 
 
 
215 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  43.66 
 
 
225 aa  158  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  38.39 
 
 
217 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  37.5 
 
 
221 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  37.5 
 
 
221 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24440  K+ transport system, NAD-binding component  40.19 
 
 
222 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.800738  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 
215 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 
220 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  38.57 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  40.27 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  35.75 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  36.82 
 
 
229 aa  137  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  37.62 
 
 
221 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  34.93 
 
 
217 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  33.17 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 
220 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 
220 aa  132  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
222 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  35.75 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  41.11 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  39.34 
 
 
222 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  37.78 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  37.74 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 
217 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
220 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  38.86 
 
 
217 aa  124  9e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 
216 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  44.1 
 
 
224 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  32.54 
 
 
217 aa  121  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  32.69 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 
217 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000127966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  34.88 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  32.37 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  30.92 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  34.86 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  32.29 
 
 
220 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  30.7 
 
 
233 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  33.96 
 
 
221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  31.92 
 
 
223 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  34.47 
 
 
218 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  31.25 
 
 
217 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  38.07 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.75 
 
 
220 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 
223 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  36.82 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  28.23 
 
 
216 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  26.7 
 
 
216 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  32.06 
 
 
220 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  27.75 
 
 
214 aa  106  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  36.23 
 
 
221 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 
221 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  30.33 
 
 
216 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  32.39 
 
 
218 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  32.16 
 
 
220 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  30.33 
 
 
216 aa  104  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  30.33 
 
 
216 aa  104  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  30.58 
 
 
220 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  32.87 
 
 
233 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  29.78 
 
 
233 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 
217 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>