275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1585 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  100 
 
 
216 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  55.87 
 
 
217 aa  257  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  38.86 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  38.86 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  40.78 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  37.26 
 
 
215 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  38.68 
 
 
215 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  38.57 
 
 
220 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  37.26 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  34.43 
 
 
227 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  38.1 
 
 
221 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  37.62 
 
 
221 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  37.62 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  35.51 
 
 
220 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  33.65 
 
 
217 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
220 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
220 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  36.67 
 
 
219 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  34.6 
 
 
217 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  36.2 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  34.27 
 
 
233 aa  145  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  36.27 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  36.74 
 
 
221 aa  142  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  36.57 
 
 
216 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  32.88 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  32.7 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  35.68 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  34.58 
 
 
233 aa  132  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
223 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  33.8 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  31.63 
 
 
224 aa  128  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  31.16 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  29.86 
 
 
222 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  31.03 
 
 
224 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  32.06 
 
 
225 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  30.62 
 
 
231 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  29.11 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  31.78 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  29.53 
 
 
227 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  31.32 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  31.1 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  32.54 
 
 
231 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  29.33 
 
 
213 aa  118  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  33 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  31.68 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  27.48 
 
 
233 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 
228 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  33 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0350  K+ transport system, NAD-binding component  33.51 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.53262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  28.43 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  27.4 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  28.1 
 
 
224 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  29.76 
 
 
225 aa  111  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  30.54 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 
250 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0796  Trk-type K+ transport systems membrane component  32.52 
 
 
220 aa  108  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  30.24 
 
 
231 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  29.72 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  30.05 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 
244 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 
222 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  30.24 
 
 
217 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  28.64 
 
 
220 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  30.35 
 
 
217 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  30.48 
 
 
216 aa  104  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1606  K+ uptake transporter, KtrA subunit  27.54 
 
 
233 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000611134  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  31.03 
 
 
232 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 
230 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  30.56 
 
 
234 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  27.83 
 
 
221 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  28.85 
 
 
235 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  0.0000719315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 
234 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  25.73 
 
 
222 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  27.49 
 
 
254 aa  101  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
230 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 
234 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  29.72 
 
 
234 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 
234 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0088  VIC family potassium channel protein  26.98 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  28.25 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>