186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5547 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
351 aa  703    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  93.31 
 
 
344 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  35.17 
 
 
341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  30.33 
 
 
354 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  32.95 
 
 
351 aa  192  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  34.1 
 
 
347 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  33.53 
 
 
347 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  35.42 
 
 
346 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  34.5 
 
 
349 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  28.67 
 
 
345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24.14 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  26.71 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.47 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  26.74 
 
 
359 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  26.94 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.09 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  27.21 
 
 
366 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  27.83 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  26.84 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.29 
 
 
332 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27 
 
 
364 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  27.6 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  27.6 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.87 
 
 
402 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.4 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  27.6 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  27.6 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  27.6 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  27.6 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  27.6 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  25.89 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  25.23 
 
 
370 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  26.42 
 
 
350 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  29.41 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  26.87 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  26.05 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.48 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  27.12 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26.05 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  27.08 
 
 
417 aa  60.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  25.89 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  25.82 
 
 
366 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  29.17 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  24.68 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  24.68 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  29.78 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  26.94 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  26.94 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  25.58 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 
359 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  29.17 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  29.17 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  23.25 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  28.9 
 
 
391 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28.14 
 
 
395 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  23.74 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  24.07 
 
 
509 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  26.67 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  26.67 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  28.1 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  26.76 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  26.86 
 
 
335 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  26.42 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  23.7 
 
 
331 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  25.4 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  26.73 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  26.73 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  26.73 
 
 
391 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  26.11 
 
 
331 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  26.11 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  26.11 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  26.11 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  23.29 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.08 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.64 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.2 
 
 
325 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  26.11 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  26.11 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  24.6 
 
 
413 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  25.38 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  24.06 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  29.73 
 
 
114 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  20.89 
 
 
513 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  23.77 
 
 
457 aa  49.7  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.08 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  24.06 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 
326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  24.73 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>