More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0186 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  100 
 
 		 513 aa  1020    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  35.46 
 
 		 405 aa  219  8.999999999999998e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  28.08 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  27.97 
 
 		 325 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  27.33 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  26.1 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  27.3 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  31.95 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  25.08 
 
 		 331 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  24.75 
 
 		 308 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  25.95 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  25.95 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  25.95 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  25.95 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  25.96 
 
 		 331 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  28.57 
 
 		 265 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  25.3 
 
 		 419 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  25.75 
 
 		 331 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  25.32 
 
 		 331 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  23.42 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  25.32 
 
 		 331 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  25.32 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  25.37 
 
 		 311 aa  90.5  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  30.68 
 
 		 267 aa  90.1  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  27.72 
 
 		 277 aa  89.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  34.03 
 
 		 277 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  24.92 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  24.68 
 
 		 331 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  32.73 
 
 		 271 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  36.24 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  32.98 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  32.6 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  32.6 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  32.42 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  26.27 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  36 
 
 		 228 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  25.97 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  31.15 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  25.19 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  26.17 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  26.48 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  27.17 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  30.69 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  30.99 
 
 		 276 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  26.8 
 
 		 269 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  30.48 
 
 		 212 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  30.77 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  26.62 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  26.46 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  26.46 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  34.72 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  26.79 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  28.33 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  30.97 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  33.72 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  30.22 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  27.46 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  36.31 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  32.76 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  33.33 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  26.23 
 
 		 271 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  25 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86010  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily B VIC  28.77 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  31.68 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  26.62 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  33.33 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  28.29 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  29.71 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3094  Ion transport 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  31.58 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  31.79 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  32.28 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  26.14 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  31.87 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  33.97 
 
 		 275 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  27.86 
 
 		 240 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3768  ion transporter  28.57 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  26.9 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  32.5 
 
 		 279 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  33.8 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  33.8 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  33.8 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3117  Ion transport 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0962789  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0855  Ion transport 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.289459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3269  Ion transport 2 domain-containing protein  26.42 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  33.8 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  24.13 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  28.57 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  24.73 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  24.85 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.56 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0824  Ion transport 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.978487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>