252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0453 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
347 aa  712    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  29.5 
 
 
363 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  26.91 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  26.58 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  26.91 
 
 
331 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  26.91 
 
 
331 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  26.91 
 
 
331 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  26.91 
 
 
331 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  29.81 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  25.91 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  26.91 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  26.25 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  26.58 
 
 
331 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  25.91 
 
 
331 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  25.52 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  24.93 
 
 
367 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.14 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.63 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.35 
 
 
334 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.35 
 
 
334 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  26.54 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.49 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.38 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.15 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.72 
 
 
332 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.15 
 
 
330 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  27.17 
 
 
430 aa  86.7  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  28.45 
 
 
331 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.71 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  23.93 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0775  Ion transport 2 domain-containing protein  25.57 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  25.07 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.64 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  25.14 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  25.27 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  26.3 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  27.66 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  27.82 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  27.82 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  27.82 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.12 
 
 
333 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.19 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  23.8 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.63 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  27.08 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.22 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  23.31 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27.12 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  23.19 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  23.19 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.03 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  27.34 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27.12 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.42 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  24.52 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  27.96 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  22.42 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  24.51 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  25 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.5 
 
 
509 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  25.43 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  24.83 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  24.72 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0900  Ion transport 2 domain protein  25.09 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.283884 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.91 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.52 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.07 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  24.69 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  26.69 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  25.99 
 
 
341 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  23.78 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  26.69 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  26.69 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  26.69 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.93 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  23.28 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  27.24 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  23.28 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  23.28 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.54 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0460  Ion transport 2 domain-containing protein  27.47 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  22.4 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  25.21 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.18 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  27.14 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  23.99 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  23.12 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>