193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5275 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 344 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5547  Ion transport 2 domain protein  93.31 
 
 		 351 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  35.78 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  33.53 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01615  hypothetical protein  33.63 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  30.33 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  35.09 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003909  putative potassium channel protein  32.44 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  35.09 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  28.52 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  23.08 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  27.16 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.95 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  26.8 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  28.32 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  28.32 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  28.32 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  28.32 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  25.99 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  28.32 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  28.32 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  28.32 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  26.32 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  24.62 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  30.15 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  27.88 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  28.71 
 
 		 430 aa  62.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  26.37 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  27 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  27 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  28.37 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  25.74 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.9 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  26.4 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  23.1 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  27.16 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  27.16 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  26.12 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  29.11 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.96 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  24.54 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  25.89 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  23.61 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  25.89 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  23.61 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26.81 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  23.61 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  26.81 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  23.2 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  24.75 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  23.79 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  28.41 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  26.54 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  23.79 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  29.04 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  26.54 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  26.54 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2916  TrkA-N domain protein  24.5 
 
 		 477 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  28.2 
 
 		 391 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  24.56 
 
 		 355 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  28.41 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  28.41 
 
 		 391 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  21.61 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8791  hypothetical protein  25.44 
 
 		 621 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  20.83 
 
 		 513 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  22.85 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  22.85 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  22.85 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  23.42 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  25.67 
 
 		 413 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.95 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.63 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  22.85 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.54 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.92 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  23.16 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  22.85 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  25.13 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.46 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.89 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  25.13 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  25.13 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  25.13 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  44.9 
 
 		 79 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.87 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>