293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0697 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 345 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  97.64 
 
 		 339 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  49.4 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  52.58 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  48.48 
 
 		 359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  48.48 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  48.48 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  47.87 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  48.17 
 
 		 359 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  48.04 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  47.27 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  52.04 
 
 		 350 aa  291  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  47.11 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06820  K+ transport system, NAD-binding component  52.87 
 
 		 370 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.074637  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  49.21 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  48.16 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  44.41 
 
 		 398 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  35.38 
 
 		 368 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  33.04 
 
 		 364 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  36.71 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  33.33 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 364 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  33.04 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  31.55 
 
 		 386 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  32.81 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  32.81 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  33.73 
 
 		 413 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  34.18 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  33.43 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  33.86 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  28.74 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  29.11 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  30.09 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.09 
 
 		 346 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  25.39 
 
 		 335 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.49 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.48 
 
 		 351 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.95 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  28.81 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  31.1 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  28.39 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  28.39 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  28.81 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.49 
 
 		 350 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.78 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31.86 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  27.65 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  25 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  27.51 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  28.78 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.36 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  27.88 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.36 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.89 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  27.07 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.64 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  29.05 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.63 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.99 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.39 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  22.67 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  24.55 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.22 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.67 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  23.91 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.45 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.78 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.54 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  32.69 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  32.21 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  27.73 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.05 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  27.07 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  23.65 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  29.32 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  24.9 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  27.73 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.97 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  23.87 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  26.2 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  26.2 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  26.2 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  26.34 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>