More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4944 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
454 aa  926    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41686  VIC family transporter: inwardly rectifying potassium ion channel  26.9 
 
 
648 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0173475  decreased coverage  0.000449346 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17765  VIC family transporter: potassium ion channel, potassium voltage-gated channel, subfamily H (Eag-related)  23.17 
 
 
735 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000050158  hitchhiker  0.00697656 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88568  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily H  24.26 
 
 
962 aa  109  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0730673  normal  0.0371223 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  34.51 
 
 
923 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  34.88 
 
 
582 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  28.35 
 
 
355 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  33.59 
 
 
582 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31611  VIC family transporter: potassium ion channel subfamily H  24.1 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0596506  hitchhiker  0.00581537 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  31.54 
 
 
868 aa  81.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  25.11 
 
 
367 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.98 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  22.49 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  29.84 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.29 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  21.69 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  25.58 
 
 
482 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  37.08 
 
 
214 aa  64.3  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  31.29 
 
 
160 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
482 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.21 
 
 
225 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.63 
 
 
225 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  28.57 
 
 
412 aa  60.1  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  33.68 
 
 
157 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
231 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
157 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  27.93 
 
 
441 aa  57.4  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.36 
 
 
171 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  39.56 
 
 
376 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 
173 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  32.32 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.74 
 
 
226 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  36.05 
 
 
303 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3546  cyclic nucleotide-binding  28.16 
 
 
124 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.39 
 
 
242 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.58 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3364  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.22 
 
 
772 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  27.43 
 
 
731 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  26.98 
 
 
811 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  24.4 
 
 
295 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.7 
 
 
225 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 
167 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
238 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  44.44 
 
 
228 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  35.79 
 
 
517 aa  53.9  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.28 
 
 
1075 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  29.05 
 
 
282 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
253 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  23.28 
 
 
153 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  26.55 
 
 
308 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  32.74 
 
 
477 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  32.63 
 
 
158 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.5 
 
 
146 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.52 
 
 
232 aa  53.5  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  34.09 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.56 
 
 
228 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.72 
 
 
141 aa  53.5  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.91 
 
 
454 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  25.55 
 
 
165 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
225 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  36.73 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  26.77 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  42.62 
 
 
276 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  22.41 
 
 
153 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  29.2 
 
 
241 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
232 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
260 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  22.5 
 
 
472 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  40 
 
 
260 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  29.41 
 
 
289 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  28.33 
 
 
289 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
260 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  28.33 
 
 
289 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  43.75 
 
 
438 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 
563 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
388 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  46.94 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
234 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  27.73 
 
 
167 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  43.75 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 
155 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  35.53 
 
 
275 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 
251 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  23.14 
 
 
948 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  33.73 
 
 
265 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.77 
 
 
311 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  38.6 
 
 
256 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  29.33 
 
 
265 aa  50.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  36.36 
 
 
325 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1167  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 
127 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1194  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 
127 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  27.1 
 
 
138 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 
487 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  27.17 
 
 
287 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  36.36 
 
 
325 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>