231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3379 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3379  Ion transport 2  100 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0913858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  62.12 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  53.61 
 
 		 279 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1866  putative K+ ion channel  51.55 
 
 		 281 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5570  Ion transport 2 domain protein  48.11 
 
 		 277 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  31.36 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  30.4 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  35.14 
 
 		 328 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  37.86 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  31.86 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  31.62 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.62 
 
 		 334 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.62 
 
 		 334 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 		 330 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  29.05 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  33.33 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  27.41 
 
 		 280 aa  61.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.52 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.06 
 
 		 330 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  32.14 
 
 		 302 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  35.24 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  35.53 
 
 		 531 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  30.89 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0363  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  31.07 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  33.72 
 
 		 335 aa  53.9  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  34.52 
 
 		 430 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  35.24 
 
 		 255 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  29.2 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  34.15 
 
 		 469 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  27.92 
 
 		 316 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 		 385 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  29.91 
 
 		 420 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  35.14 
 
 		 517 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  27.08 
 
 		 272 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  31.67 
 
 		 409 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  29.91 
 
 		 420 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0694  Ion transport 2  32.99 
 
 		 276 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000792601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1424  Ion transport 2 domain protein  26.32 
 
 		 253 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.287794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  29.29 
 
 		 438 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  42.11 
 
 		 405 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  29.29 
 
 		 408 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  26.88 
 
 		 357 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  34.07 
 
 		 282 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  28.68 
 
 		 292 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3485  Ion transport 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.319934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1192  Ion transport protein  30.95 
 
 		 277 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.645124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  30.84 
 
 		 260 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2671  ion transporter  28.21 
 
 		 280 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  32.29 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  32.58 
 
 		 269 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3841  ion transport 2 domain-containing protein  26.39 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  unclonable  0.000000000129627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  37.7 
 
 		 412 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  30.15 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 408 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  31.91 
 
 		 419 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  30.21 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  32.32 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0719  Ion transport 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000693847  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  29.2 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004526  cAMP-dependent Kef-type K+ transport system  29.21 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  37.1 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 331 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  34.07 
 
 		 231 aa  47.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  32.32 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  28.44 
 
 		 448 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  34.41 
 
 		 251 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  26.87 
 
 		 273 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  30.88 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  30.88 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  30.88 
 
 		 391 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 409 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  32.81 
 
 		 277 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 331 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0620  ion transport 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 264 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  27.73 
 
 		 295 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  27.36 
 
 		 228 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  30.65 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  43.75 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  32.18 
 
 		 331 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  24.17 
 
 		 265 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  29.59 
 
 		 305 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  28.3 
 
 		 331 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  32.79 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  29.51 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  31.63 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  42.11 
 
 		 388 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  31.15 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  28.26 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  29.69 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  34.88 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>