206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0098 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  39.42 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0743  hypothetical protein  38.26 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0590  Ion transport 2 domain-containing protein  41.58 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0642  hypothetical protein  38.26 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0586  potassium channel protein  38.26 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000724625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0585  potassium channel protein  38.26 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0803  hypothetical protein  38.26 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0676  hypothetical protein  38.26 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000494149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0731  hypothetical protein  38.26 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0746600000000001e-44 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  35.87 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1687  Ion transport 2 domain protein  31.73 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355661  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  43.55 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0587  potassium channel protein  41.03 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  41.94 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  41.94 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  35.58 
 
 		 469 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  42.03 
 
 		 438 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  42.03 
 
 		 408 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.35 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  33.77 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.55 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  34.69 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  29 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  29.46 
 
 		 355 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  49.23 
 
 		 448 aa  57  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  41.27 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  30.43 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  35.11 
 
 		 354 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  37.04 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  33.72 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  33.72 
 
 		 356 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  37.1 
 
 		 347 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  30.84 
 
 		 807 aa  53.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  41.54 
 
 		 277 aa  53.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  39.29 
 
 		 420 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  30.83 
 
 		 302 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  39.29 
 
 		 420 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  29.25 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2474  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.87557e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  27.69 
 
 		 265 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  27.06 
 
 		 265 aa  52  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  26.88 
 
 		 350 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 		 341 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 273 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  35.85 
 
 		 341 aa  50.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  26.88 
 
 		 350 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  31.58 
 
 		 335 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  37.31 
 
 		 517 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  38.18 
 
 		 339 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  38.89 
 
 		 335 aa  50.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  35.9 
 
 		 356 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 		 509 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  32.65 
 
 		 362 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  27.18 
 
 		 700 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  27.72 
 
 		 288 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.71 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  28.45 
 
 		 430 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  36.21 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  29.66 
 
 		 398 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1119  Ion transport 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 279 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  35.9 
 
 		 265 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  31.51 
 
 		 948 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  27.35 
 
 		 241 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.61 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  29.76 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  30.93 
 
 		 376 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  31.94 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  29.27 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  41.38 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  26.85 
 
 		 325 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.41 
 
 		 351 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  32.89 
 
 		 357 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  38.6 
 
 		 359 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  32 
 
 		 337 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  44 
 
 		 396 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  31.58 
 
 		 269 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  30.77 
 
 		 316 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  30.51 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3759  Ion transport 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 265 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  30.49 
 
 		 371 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  27.83 
 
 		 263 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  30.16 
 
 		 275 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  32.65 
 
 		 288 aa  46.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  40 
 
 		 402 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  25.93 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  31.73 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  32.73 
 
 		 346 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  40 
 
 		 402 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  33.78 
 
 		 531 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  41.46 
 
 		 454 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  26.77 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  45.65 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  25.66 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  45.65 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  27.69 
 
 		 416 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  31.37 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>