53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04950 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  100 
 
 
807 aa  1677    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  29.33 
 
 
700 aa  155  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  29.08 
 
 
277 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  24.28 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  26.79 
 
 
265 aa  65.1  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  20.7 
 
 
469 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  39.39 
 
 
335 aa  54.7  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  30.84 
 
 
131 aa  54.3  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  27.39 
 
 
356 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  34.94 
 
 
354 aa  53.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  41.07 
 
 
341 aa  52.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  42.37 
 
 
335 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  31.58 
 
 
351 aa  51.6  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  33.73 
 
 
330 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  31.58 
 
 
351 aa  51.6  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  31.58 
 
 
351 aa  51.6  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  32.53 
 
 
337 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  32.53 
 
 
330 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  37.88 
 
 
335 aa  51.6  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  32.53 
 
 
334 aa  51.2  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  31.18 
 
 
351 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  32.53 
 
 
334 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.53 
 
 
330 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 
330 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32938  predicted protein  23.79 
 
 
208 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 
350 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  30.69 
 
 
344 aa  50.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  29.36 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  41.51 
 
 
351 aa  49.7  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  20.83 
 
 
948 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5246  potassium channel protein, N-terminus  30 
 
 
146 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0630714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 
336 aa  49.3  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  34.21 
 
 
128 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  34.92 
 
 
359 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.12 
 
 
330 aa  48.5  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  26.97 
 
 
119 aa  48.5  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.55 
 
 
376 aa  48.5  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  30.86 
 
 
135 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  29.27 
 
 
375 aa  47.8  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  44.44 
 
 
352 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  36.67 
 
 
346 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  23.73 
 
 
384 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  36.67 
 
 
346 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  31 
 
 
341 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  32.43 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  31.07 
 
 
332 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  31.87 
 
 
346 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  30.25 
 
 
260 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  30.25 
 
 
260 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  23.71 
 
 
347 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  31.03 
 
 
352 aa  45.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
341 aa  45.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  28.21 
 
 
241 aa  44.3  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>