131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43530 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  100 
 
 
356 aa  733    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  35.42 
 
 
277 aa  178  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  30.5 
 
 
448 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  27.44 
 
 
469 aa  143  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  28.57 
 
 
265 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  30.12 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  30.12 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  30.12 
 
 
346 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  33.66 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  27.39 
 
 
807 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  25.34 
 
 
948 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  27.75 
 
 
700 aa  53.9  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  32.53 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  30.67 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  32 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  30.83 
 
 
368 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46302  predicted protein  27.97 
 
 
504 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  27.47 
 
 
128 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
335 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  32.38 
 
 
273 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  32.61 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  38 
 
 
113 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  31.03 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  31.65 
 
 
354 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.72 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 
335 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  41.51 
 
 
517 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  29.2 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  32.26 
 
 
332 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  36.96 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  35.9 
 
 
131 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  40.82 
 
 
396 aa  50.1  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  29 
 
 
274 aa  49.7  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1687  Ion transport 2 domain protein  30.39 
 
 
123 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.75 
 
 
338 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  27.54 
 
 
79 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  29.89 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  29.89 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.92 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  29.89 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  29.89 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30.17 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  28.72 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0605  Ion transport 2 domain protein  36 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  27.78 
 
 
244 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1030  conserved hypothetical protein (TrkA domain protein)  28.87 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.583921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  35.14 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30.17 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  29.89 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30.17 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  24.3 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 
347 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  33.33 
 
 
273 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
350 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  30.69 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2923  Ion transport protein  29.87 
 
 
271 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.84 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  34.41 
 
 
728 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  38.98 
 
 
263 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.85 
 
 
325 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  37.74 
 
 
228 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  28.21 
 
 
428 aa  47  0.0005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.24 
 
 
384 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  23.36 
 
 
325 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  27.5 
 
 
366 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  30.26 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.53 
 
 
337 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  23.53 
 
 
330 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  36.67 
 
 
268 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  34.41 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.96 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.96 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  35.42 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  27.85 
 
 
357 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  38.6 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  30 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  45.45 
 
 
135 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  39.62 
 
 
280 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  26.56 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.55 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  33.33 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.96 
 
 
330 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32938  predicted protein  30.41 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  37.78 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.92 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.96 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  31.52 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  28.21 
 
 
416 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>