72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_44021 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  100 
 
 
728 aa  1516    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  39.74 
 
 
128 aa  61.6  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  35.45 
 
 
335 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  44.29 
 
 
277 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  46.77 
 
 
114 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  42.47 
 
 
335 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  45.16 
 
 
114 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  42.47 
 
 
335 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0590  Ion transport 2 domain-containing protein  43.55 
 
 
114 aa  57.4  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  41.27 
 
 
131 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.65 
 
 
341 aa  56.2  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0743  hypothetical protein  43.55 
 
 
114 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0676  hypothetical protein  43.55 
 
 
114 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000494149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0585  potassium channel protein  43.55 
 
 
114 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  31.78 
 
 
351 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0731  hypothetical protein  43.55 
 
 
114 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0746600000000001e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0642  hypothetical protein  43.55 
 
 
114 aa  55.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0803  hypothetical protein  43.55 
 
 
114 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0586  potassium channel protein  43.55 
 
 
114 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000724625  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  40.74 
 
 
276 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  32.58 
 
 
350 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 
350 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  33.33 
 
 
948 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  32.35 
 
 
350 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  30.39 
 
 
371 aa  52  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  35.62 
 
 
271 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.44 
 
 
351 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.17 
 
 
333 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  38.36 
 
 
272 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0685  Ion transport protein  35.14 
 
 
297 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.301571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0773  ion transporter  35.14 
 
 
297 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.888374  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
344 aa  49.7  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  34.57 
 
 
135 aa  48.5  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  34.18 
 
 
287 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  36.11 
 
 
288 aa  47.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 
336 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  31.46 
 
 
419 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  35.21 
 
 
282 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 
347 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  34.41 
 
 
356 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3339  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
354 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  44.23 
 
 
268 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01080  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
554 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.160096  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  33.8 
 
 
79 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  34.29 
 
 
290 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  32.18 
 
 
255 aa  45.8  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  29.91 
 
 
278 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  33.93 
 
 
113 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  31.51 
 
 
269 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  32.97 
 
 
273 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  29.91 
 
 
278 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  29.91 
 
 
278 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  39.58 
 
 
339 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  29.91 
 
 
278 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  29.91 
 
 
278 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4211  Ion transport protein  26.83 
 
 
283 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.22 
 
 
408 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 
346 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0178  VIC family potassium channel protein  32.88 
 
 
282 aa  45.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  37.84 
 
 
263 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  32.39 
 
 
277 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  33.85 
 
 
336 aa  44.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  31.03 
 
 
212 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  24.76 
 
 
273 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  33.8 
 
 
290 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  30.14 
 
 
269 aa  44.3  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  30.99 
 
 
274 aa  44.3  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  26.92 
 
 
268 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  30.86 
 
 
346 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  25.68 
 
 
454 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  39.53 
 
 
202 aa  44.3  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
268 aa  43.9  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>