74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0402 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  100 
 
 
113 aa  224  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  38 
 
 
356 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  32.05 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  46.97 
 
 
269 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  37.74 
 
 
509 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  29.76 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  43.64 
 
 
265 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  41.18 
 
 
448 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  34.41 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  37.33 
 
 
277 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  35.71 
 
 
517 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 
350 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  33.93 
 
 
728 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  32.84 
 
 
341 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1223  Ion transport 2  31.17 
 
 
349 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  37.29 
 
 
265 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  40.48 
 
 
396 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  45.65 
 
 
405 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  40.48 
 
 
333 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.85 
 
 
352 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  38.46 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  39.53 
 
 
347 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  32 
 
 
273 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  37.14 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 
335 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0518  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  40.74 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  37.14 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  37.14 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  34.38 
 
 
251 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  32.58 
 
 
272 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  45.28 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  34.78 
 
 
238 aa  42  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
371 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32 
 
 
356 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  32.53 
 
 
273 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  35.48 
 
 
271 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  35.14 
 
 
279 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41686  VIC family transporter: inwardly rectifying potassium ion channel  35.29 
 
 
648 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0173475  decreased coverage  0.000449346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  36.14 
 
 
249 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01339  Kef-type K+ transport system, predicted NAD-binding component  45.65 
 
 
351 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  44.19 
 
 
253 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  37.14 
 
 
289 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  33.87 
 
 
252 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  41.3 
 
 
269 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  37.5 
 
 
231 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  35.56 
 
 
393 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  44.74 
 
 
430 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 
355 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  41.3 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  50 
 
 
279 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  32.81 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  42.5 
 
 
357 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  33.33 
 
 
295 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  32.81 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  32.81 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  38.24 
 
 
289 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  41.3 
 
 
269 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  36.36 
 
 
272 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 
335 aa  40.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  31.25 
 
 
350 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0129  Ion transport 2 domain protein  34.38 
 
 
241 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000177719  hitchhiker  0.0000693343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  34.67 
 
 
279 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  44.26 
 
 
277 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  34.29 
 
 
807 aa  40.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 
335 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  46 
 
 
275 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_002950  PG1606  ion transporter  40 
 
 
240 aa  40  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 
531 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  35.71 
 
 
284 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  35.71 
 
 
284 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  35.71 
 
 
284 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>