96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43171 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43171  predicted protein  100 
 
 
448 aa  922    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899265  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38821  predicted protein  47.73 
 
 
469 aa  330  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  34.19 
 
 
277 aa  192  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  30.82 
 
 
356 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41153  VIC family transporter: calcium-activated outward-rectifying potassium ion channel  26.99 
 
 
265 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  24.28 
 
 
807 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  25.29 
 
 
700 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46341  predicted protein  24.02 
 
 
948 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  49.23 
 
 
131 aa  57  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  34.41 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  34.41 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  38.46 
 
 
391 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2859  potassium channel protein  29.58 
 
 
128 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00499933  normal  0.0280654 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  38.46 
 
 
391 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  38.46 
 
 
391 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43813  VIC family transporter: potassium ion channel  32.88 
 
 
79 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  34.62 
 
 
335 aa  53.5  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  26.88 
 
 
252 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0608  Ion transport 2 domain protein  30.77 
 
 
135 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 
346 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  32.93 
 
 
355 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  33.78 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 
324 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
273 aa  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  25.81 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  25.81 
 
 
260 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26.61 
 
 
408 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  24.39 
 
 
251 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  30.56 
 
 
335 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  39.29 
 
 
276 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1097  Ion transport 2 domain-containing protein  29.17 
 
 
140 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168795  normal  0.504261 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 
335 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  28.72 
 
 
335 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0402  Ion transport, K+ channel  41.18 
 
 
113 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.234978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  25.58 
 
 
328 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  31.52 
 
 
420 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  31.52 
 
 
420 aa  47.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.76 
 
 
351 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46302  predicted protein  24.22 
 
 
504 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  27.17 
 
 
376 aa  46.6  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  32.65 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  31 
 
 
395 aa  46.6  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.47 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2003  Ion transport 2 domain protein  27.5 
 
 
269 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.191416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  26.09 
 
 
354 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  25.32 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4045  Ion transport 2 domain protein  34.62 
 
 
119 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.94 
 
 
350 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  37.74 
 
 
244 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  35.8 
 
 
344 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  32.76 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  32.76 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  33.82 
 
 
244 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
350 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0590  Ion transport 2 domain-containing protein  31.75 
 
 
114 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  32.76 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30.56 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  28.04 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  30.85 
 
 
337 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  40 
 
 
396 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.27 
 
 
351 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  32.73 
 
 
359 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  32.35 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  30.21 
 
 
333 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  29.7 
 
 
359 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  40.98 
 
 
366 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  27.68 
 
 
454 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  28.43 
 
 
517 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.93 
 
 
352 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
336 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  21.6 
 
 
332 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  29.07 
 
 
241 aa  43.9  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  31.9 
 
 
255 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  31.75 
 
 
114 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0253  Ion transport 2 domain protein  27.27 
 
 
260 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 
341 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  31.97 
 
 
728 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  37.74 
 
 
409 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  32.94 
 
 
325 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  38.3 
 
 
352 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  24.76 
 
 
397 aa  43.5  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  22.5 
 
 
280 aa  43.1  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 
336 aa  43.1  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>