69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2650 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  27.61 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2088  Ion transport 2 domain-containing protein  31.41 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  25.89 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  29.25 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  27.34 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  45.83 
 
 		 327 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2774  Ion transport 2 domain protein  34.48 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000298794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3070  Ion transport 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.550123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 330 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  29.76 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 327 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  31.17 
 
 		 141 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 141 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 327 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  25 
 
 		 316 aa  48.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 148 aa  48.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 408 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  24.29 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43530  predicted protein  25.87 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  25 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29 
 
 		 419 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  32.88 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 		 509 aa  45.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  41.82 
 
 		 149 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  36.92 
 
 		 274 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0960  Ion transport 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 297 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  30.53 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0098  hypothetical protein  30.86 
 
 		 131 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2413  Ion transport 2 domain-containing protein  34.04 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  45.24 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44021  predicted protein  39.53 
 
 		 728 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  29.06 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1457  Kef-type K+ transport system NAD-binding protein  26.73 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  45.24 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1581  Ion transport 2 domain-containing protein  46.94 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  33.33 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  45.24 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  45.24 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  45.24 
 
 		 391 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31186  outward-rectifier potassium channel  28.57 
 
 		 700 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  23.72 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  30.26 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_3676  predicted protein  34.43 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  32.04 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  25.45 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  28.57 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  30.14 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  26.92 
 
 		 148 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  28.83 
 
 		 275 aa  42  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 		 341 aa  42  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  30.88 
 
 		 277 aa  42  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  42 
 
 		 149 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2564  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108416  decreased coverage  0.00000252987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2297  Ion transport protein  33.33 
 
 		 289 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  40 
 
 		 271 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 132 aa  41.6  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  32.5 
 
 		 517 aa  41.6  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  26.12 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  34.12 
 
 		 428 aa  41.2  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  53.33 
 
 		 359 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>