50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1124 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  316  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  82.61 
 
 		 172 aa  262  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  76.02 
 
 		 361 aa  253  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  52.9 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  44.06 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  48.92 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  39.57 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  38.85 
 
 		 141 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  37.25 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  37.69 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  38.84 
 
 		 129 aa  89  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  40.15 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  35.33 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  32 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  37.08 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  30.99 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  38.75 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  31.07 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  32.62 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  26.57 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  31 
 
 		 132 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  48.78 
 
 		 326 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  38.55 
 
 		 222 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 327 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  29.6 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  51.02 
 
 		 290 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  43.9 
 
 		 327 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 330 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  31.87 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  32.18 
 
 		 269 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  38.89 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  33.93 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  34.52 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  31.03 
 
 		 175 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0186  Ion transport 2  33.06 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.877923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0195  Ion transport 2 domain-containing protein  33.06 
 
 		 311 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8080  hypothetical protein  86.96 
 
 		 100 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363748  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  35.82 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>