39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0306 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  60.28 
 
 
141 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  58.87 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  57.14 
 
 
149 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  56.74 
 
 
141 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  59.84 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  45.11 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  41.35 
 
 
143 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  34.04 
 
 
160 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  40.15 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  38.13 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  37.41 
 
 
361 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  35.88 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  36.36 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  37.96 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  35.71 
 
 
111 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  33.96 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  29.59 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  32.99 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  30.37 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  42.31 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  32.52 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  37.88 
 
 
327 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  31.18 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  38.46 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  52.78 
 
 
330 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  52.78 
 
 
327 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  29.91 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 
326 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  41.51 
 
 
327 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  30.28 
 
 
271 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  29.36 
 
 
269 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  36.99 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  44.23 
 
 
222 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  37.63 
 
 
234 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  30.23 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>