44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3241 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  59.71 
 
 		 148 aa  146  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  52.9 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  50 
 
 		 172 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  48.55 
 
 		 361 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  43.41 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  38.41 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  36.17 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  38.21 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  38.24 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  41.35 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  39.67 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.88 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  33.7 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  32.69 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  34.02 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  41.67 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1358  hypothetical protein  30.3 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.250908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  44 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  27.4 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0591  hypothetical protein  31.31 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  39.66 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  32.26 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  42.31 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  33.33 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  30.37 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2088  Ion transport 2 domain-containing protein  38.36 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  42.22 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  45.1 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  31.75 
 
 		 271 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>