58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1665 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  75.36 
 
 		 141 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  73.57 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  73.19 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  59.84 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  57.14 
 
 		 148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  33.78 
 
 		 160 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  38.41 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  36.69 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  35.66 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 172 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  36.17 
 
 		 361 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  37.59 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  34.56 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  34 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  34 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  38.81 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  38.71 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  41.54 
 
 		 276 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  29.81 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2957  Ion transport 2 domain protein  37.04 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00024289  hitchhiker  0.0035902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  50 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3770  ion transport 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541985 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4046  ion transport 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205691  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0372  Ion transport 2 domain protein  47.5 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.606309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0665  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  30.38 
 
 		 317 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0276216  normal  0.0192333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0749  Ion transport 2 domain protein  38.71 
 
 		 234 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  48.65 
 
 		 327 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  50 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2020  Ion transport protein  32.81 
 
 		 282 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  45.95 
 
 		 330 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  35.9 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  40.32 
 
 		 249 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2962  hypothetical protein  28.87 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  45.95 
 
 		 327 aa  42  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  45.95 
 
 		 326 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  44.23 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  45.95 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  47.5 
 
 		 228 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 268 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  51.35 
 
 		 271 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2009  K channel inward rectifier conserved region 2 domain protein  40.91 
 
 		 311 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.908322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  54.29 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  54.29 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  50 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  39.66 
 
 		 247 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  48.84 
 
 		 228 aa  40  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0175  Ion transport 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 290 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.733026  normal  0.37729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  68 
 
 		 224 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>