192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0839 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 327 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  84.1 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  83.69 
 
 		 326 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  78.29 
 
 		 327 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  71.47 
 
 		 330 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  28.62 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  35.78 
 
 		 126 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  26.54 
 
 		 521 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.77 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.96 
 
 		 537 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  35.11 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  35.11 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  35.79 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.19 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.19 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 149 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 149 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  34.11 
 
 		 225 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  48.21 
 
 		 526 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.78 
 
 		 745 aa  52.8  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40.24 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40.24 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.66 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.58 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.23 
 
 		 567 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.95 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.56 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.56 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 446 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.7  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  39.77 
 
 		 194 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  41.54 
 
 		 133 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 517 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.27 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.14 
 
 		 489 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.32 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.5 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  26.12 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  39.76 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.47 
 
 		 776 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  31.5 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  35.51 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  27.12 
 
 		 646 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 416 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.61 
 
 		 493 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  38.55 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  42.25 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  23.3 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.42 
 
 		 214 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 		 340 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  33.9 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  28.46 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 973 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.46 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  31.43 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 		 184 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  39.73 
 
 		 247 aa  46.6  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  43.33 
 
 		 522 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 		 900 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0811  hypothetical protein  26.28 
 
 		 460 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.160858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.81 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 182 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  33.61 
 
 		 187 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 497 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  31.43 
 
 		 217 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 130 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 190 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 261 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 261 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  37.93 
 
 		 249 aa  45.8  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  42.37 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  37.97 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1033 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 710 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  43.66 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.71 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  50 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>