More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2987 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
130 aa  258  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  49.59 
 
 
264 aa  93.6  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  41.01 
 
 
357 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  55.32 
 
 
1033 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  51 
 
 
286 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 
356 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  53.61 
 
 
449 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  48.15 
 
 
332 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  39.01 
 
 
218 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  49.51 
 
 
973 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  39.52 
 
 
391 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  48.08 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  48.11 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  40.34 
 
 
381 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  54.65 
 
 
386 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  48.94 
 
 
521 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.73 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  47.42 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  47.42 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
277 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 
389 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  49 
 
 
567 aa  71.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  50.51 
 
 
343 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  51.04 
 
 
260 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  47.47 
 
 
263 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  50.51 
 
 
343 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  40.28 
 
 
262 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  38.4 
 
 
285 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  44.9 
 
 
900 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  42.59 
 
 
245 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 
262 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  52.17 
 
 
293 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  48.57 
 
 
216 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 
408 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  46 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  47.47 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  49.52 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.8 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  38.58 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.88 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.45 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  44.04 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  42.73 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  41.6 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  44.04 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  46 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  51 
 
 
369 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
433 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  49.52 
 
 
309 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  43.16 
 
 
563 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0884  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  43.16 
 
 
563 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741036  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  49.32 
 
 
824 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 
438 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 
447 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  50.52 
 
 
254 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  50.52 
 
 
254 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  48.11 
 
 
517 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.07 
 
 
526 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  52.27 
 
 
256 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  42.06 
 
 
949 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  47.96 
 
 
745 aa  67  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 
300 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  43.88 
 
 
219 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  49.5 
 
 
182 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41.51 
 
 
537 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 
213 aa  66.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  41.51 
 
 
522 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
214 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  45.05 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  44.23 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  36 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 
493 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  43.43 
 
 
1901 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  44.66 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  45.92 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  42 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  45.92 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 
514 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.72 
 
 
14916 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 
331 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  35.1 
 
 
412 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 
361 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  42.2 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  41 
 
 
600 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>