More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0823 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 356 aa  730    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  63.54 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0537  pentapeptide repeat protein  67.24 
 
 		 338 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  48.68 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.78 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  48.15 
 
 		 218 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  46.43 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  47.25 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  43.02 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  37.4 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  41.86 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  36.21 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  53.52 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  53.42 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 123 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  52.24 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  52.24 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  37 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.83 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0114  hypothetical protein  37.86 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  40.4 
 
 		 973 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.74 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  49.3 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  37.25 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  51.61 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  36.89 
 
 		 438 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.05 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  48.39 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  34.19 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  56.45 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 		 567 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  38.83 
 
 		 180 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  45.95 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4526  pentapeptide repeat protein  48.84 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.51706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  34.09 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  42.68 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  37.36 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  57.14 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0386  pentapeptide repeat protein  52.83 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  49.32 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  40.3 
 
 		 442 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 493 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 129 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.18 
 
 		 1033 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 		 903 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  45.95 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  34.15 
 
 		 517 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  49.12 
 
 		 844 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  52.63 
 
 		 345 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  48.39 
 
 		 260 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.12 
 
 		 525 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 184 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  44.29 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  44.29 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  44.29 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  44.29 
 
 		 273 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  52.38 
 
 		 179 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  44.29 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  45.59 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  44.29 
 
 		 273 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  51.43 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 446 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 		 149 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  44.29 
 
 		 273 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 		 149 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  44.19 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 825 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  46.15 
 
 		 168 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 825 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  52.83 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  51.67 
 
 		 900 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 825 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 825 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 825 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>