More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1383 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
327 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  38.61 
 
 
245 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  49.58 
 
 
215 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  44.54 
 
 
681 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  54.17 
 
 
1033 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 
181 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  50.86 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  56.57 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  43.8 
 
 
332 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.54 
 
 
903 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  45.16 
 
 
973 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  45.19 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  45.79 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  45.79 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  53.19 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  40.69 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  54.64 
 
 
184 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
824 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  49.02 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.74 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  49.02 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
567 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  46.3 
 
 
727 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  39.83 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.93 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  46.3 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  32 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  38.74 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.26 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.74 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  44.9 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  44.66 
 
 
165 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  50.5 
 
 
776 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  42.16 
 
 
830 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.97 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  42.45 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  50 
 
 
745 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  51.4 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
483 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  49.48 
 
 
447 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  40.32 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  51.11 
 
 
449 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  44.12 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 
493 aa  69.3  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  35.83 
 
 
442 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.5 
 
 
180 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  41.07 
 
 
706 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
830 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  47.92 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 
215 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  41.07 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  46.15 
 
 
254 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.02 
 
 
214 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  41.07 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  47.92 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 
524 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  42.71 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  40.94 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.1 
 
 
204 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  47.92 
 
 
862 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  45.88 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  41.73 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.44 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  44.55 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  45.37 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  35.25 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 
218 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  38.39 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.26 
 
 
14916 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  48.18 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  41.59 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  37.17 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  40.95 
 
 
710 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>