More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1728 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 389 aa  781    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  38.76 
 
 		 408 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  36.05 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.82 
 
 		 446 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  37.64 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  32.55 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  31.51 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  32.44 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  30.42 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  28.5 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  30.08 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.06 
 
 		 309 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.44 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.89 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  33.23 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 		 576 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.23 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  46.34 
 
 		 533 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.75 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.75 
 
 		 515 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 		 285 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.32 
 
 		 493 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.45 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.15 
 
 		 264 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2064  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 		 540 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.83 
 
 		 517 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  36.78 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  36.78 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  43.09 
 
 		 524 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 489 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  44.72 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 		 862 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  43.09 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.14 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 		 1191 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  52.27 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  37.91 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  47.66 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.9 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  36.91 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.46 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.69 
 
 		 493 aa  79.3  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.16 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  30.09 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 		 870 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  31.6 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.56 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  48.18 
 
 		 745 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  52.81 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  36.24 
 
 		 222 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  33.55 
 
 		 862 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  44.26 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  42.74 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  36.3 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  42.5 
 
 		 190 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.93 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.09 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  30.92 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 825 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  29.32 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  29.55 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 825 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  43.65 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 825 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  29.32 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  39.35 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 825 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.68 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  45.28 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  33.22 
 
 		 825 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>