More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2767 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
408 aa  820    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  45.77 
 
 
450 aa  351  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  45.56 
 
 
447 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  41.97 
 
 
446 aa  316  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 
447 aa  260  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  36.58 
 
 
442 aa  244  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 
389 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  34.03 
 
 
432 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.3 
 
 
412 aa  166  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  31.54 
 
 
408 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  32.49 
 
 
438 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 
393 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.83 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  29.84 
 
 
420 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 
401 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.45 
 
 
401 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.1 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.5 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.38 
 
 
862 aa  125  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.63 
 
 
351 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.36 
 
 
340 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.73 
 
 
493 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.68 
 
 
332 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.96 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 
576 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.1 
 
 
333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 
319 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.49 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.22 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 
264 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  33.04 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  33.01 
 
 
295 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 
268 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 
343 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 
343 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 
776 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.88 
 
 
386 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 
521 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  33.54 
 
 
517 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.79 
 
 
448 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 
291 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
489 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 
291 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.23 
 
 
336 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.23 
 
 
336 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.68 
 
 
567 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  35 
 
 
225 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.95 
 
 
515 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
266 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
267 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 
493 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.07 
 
 
1191 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.04 
 
 
309 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  30.49 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 
870 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.97 
 
 
278 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.4 
 
 
872 aa  96.3  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.29 
 
 
285 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  40.7 
 
 
260 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 
433 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 
294 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.33 
 
 
214 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
483 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 
929 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  35.06 
 
 
227 aa  89.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  29.06 
 
 
363 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 
392 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.73 
 
 
349 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 
206 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.33 
 
 
179 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.42 
 
 
245 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  50.96 
 
 
143 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 
862 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  27.52 
 
 
881 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 
825 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
880 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  27.95 
 
 
262 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
880 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
880 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  30.72 
 
 
825 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  44.53 
 
 
180 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  27.85 
 
 
880 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 
262 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 
880 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.47 
 
 
877 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.85 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.57 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.45 
 
 
825 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.94 
 
 
234 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0114  hypothetical protein  30.57 
 
 
235 aa  84  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>