More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0225 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 447 aa  908    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  46.86 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 		 450 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.09 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  36.49 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  37.64 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  29.68 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  31.08 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  29.46 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.15 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.2 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.2 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.04 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.42 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  27.71 
 
 		 393 aa  120  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  30.75 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.16 
 
 		 862 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  26.85 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.53 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.67 
 
 		 333 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  29.89 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.66 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.73 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.88 
 
 		 319 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 		 351 aa  97.4  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  26.6 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.35 
 
 		 286 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 		 340 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.13 
 
 		 576 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.72 
 
 		 336 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.72 
 
 		 336 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 		 309 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  34.29 
 
 		 745 aa  90.9  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.39 
 
 		 1191 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.46 
 
 		 607 aa  90.9  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  27.34 
 
 		 870 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  28.33 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  34.78 
 
 		 225 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25.98 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.16 
 
 		 320 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  28.44 
 
 		 343 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  28.44 
 
 		 343 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  27.02 
 
 		 392 aa  86.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.34 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 		 881 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 872 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 		 903 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  38.4 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.86 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  38.32 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 		 1033 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.06 
 
 		 234 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.26 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  34.64 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  33.75 
 
 		 174 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.15 
 
 		 710 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 		 900 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.94 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.14 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.75 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 262 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 175 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  35.94 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  39.32 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  34.91 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  33.89 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  34.91 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.55 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  39.57 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.41 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  23.9 
 
 		 1039 aa  77  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>