More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3456 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  44.92 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  44.86 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  44.86 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  40.22 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.19 
 
 		 356 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  41.72 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  39.64 
 
 		 195 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 		 432 aa  95.9  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.7 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  41.71 
 
 		 412 aa  95.9  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.2 
 
 		 489 aa  95.5  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  47.1 
 
 		 286 aa  93.6  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  37.65 
 
 		 446 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  42.54 
 
 		 336 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  42.54 
 
 		 336 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  41.1 
 
 		 381 aa  91.7  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.34 
 
 		 441 aa  90.9  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.21 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 		 447 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  44.29 
 
 		 745 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 449 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 262 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 332 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.51 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 		 216 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 		 567 aa  89  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.03 
 
 		 386 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 450 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.86 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 		 973 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 291 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.67 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  44.52 
 
 		 219 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 291 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.87 
 
 		 182 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  48.18 
 
 		 493 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 300 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  50 
 
 		 294 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.87 
 
 		 319 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 		 442 aa  85.1  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  43.54 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  48.06 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  45.8 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  45.8 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.06 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  46.88 
 
 		 1033 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.22 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 		 521 aa  82  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  40.56 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  42.38 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  36.87 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.61 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  38.06 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  42.86 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  37.71 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  36.52 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  42.62 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.8 
 
 		 576 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.18 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.64 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  43.61 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 		 433 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  41.91 
 
 		 440 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.13 
 
 		 408 aa  78.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  33.89 
 
 		 447 aa  78.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  34.01 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  33.33 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.14 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  33.33 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  42.36 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  41.22 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  34.55 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.42 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  38.55 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.51 
 
 		 862 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  35.38 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  38.55 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>