More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2409 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
123 aa  244  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  38.02 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.16 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  42.98 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  37.19 
 
 
356 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 
357 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  40.16 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.59 
 
 
600 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 
362 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0114  hypothetical protein  38.79 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149711  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  38.79 
 
 
243 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 
206 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 
393 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  43.88 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 
446 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  44.33 
 
 
489 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  48.31 
 
 
433 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  36.22 
 
 
432 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 
412 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  45.98 
 
 
381 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  36.8 
 
 
408 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  34.71 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  39.81 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  30.65 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.74 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 
441 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  29.19 
 
 
279 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  29.19 
 
 
279 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  44.76 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  43.3 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  37.39 
 
 
438 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.13 
 
 
222 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  43.16 
 
 
449 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  37.27 
 
 
295 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  38.74 
 
 
420 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  37.96 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  35.07 
 
 
450 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 
277 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.7 
 
 
260 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
320 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 
266 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.62 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  45.98 
 
 
369 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
862 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
182 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  33.05 
 
 
195 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  44.58 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0823  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000611936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  43.01 
 
 
225 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  47.89 
 
 
824 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  42.35 
 
 
681 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  43.33 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4656  pentapeptide repeat protein  29.51 
 
 
357 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  29.84 
 
 
262 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  41.05 
 
 
309 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  35.11 
 
 
210 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
825 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
825 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  42.39 
 
 
245 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
825 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
216 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 
267 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.71 
 
 
1033 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
825 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  38.39 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
825 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.83 
 
 
340 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 
447 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  33.94 
 
 
205 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 
442 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  45.16 
 
 
727 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  40.66 
 
 
189 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.32 
 
 
213 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  41.11 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 
336 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 
336 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3010  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
233 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 
886 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
903 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
522 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  43.96 
 
 
215 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 
315 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.45 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.68 
 
 
332 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 
311 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  47.56 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>