More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2272 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 681 aa  1340    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 		 327 aa  86.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  42.74 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  33.74 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 215 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.44 
 
 		 1033 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  40.52 
 
 		 250 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.57 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  36.67 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  36.43 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 343 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.66 
 
 		 343 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.82 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  43.88 
 
 		 449 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  35.46 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.33 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.88 
 
 		 386 aa  70.5  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.68 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  30.39 
 
 		 181 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  41.03 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  35.4 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  45.71 
 
 		 142 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.01 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 862 aa  68.6  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  37.27 
 
 		 145 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  45.63 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  46.24 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.43 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 256 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  37.96 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  41.75 
 
 		 176 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  41.75 
 
 		 176 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  39.45 
 
 		 194 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  43.56 
 
 		 256 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 267 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 		 420 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.4 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.35 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  38.98 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 		 567 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.17 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  41.58 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  34.71 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  38.83 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.21 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  38.24 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 369 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.67 
 
 		 222 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.71 
 
 		 268 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  44.33 
 
 		 218 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  30.16 
 
 		 205 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  36 
 
 		 222 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 		 222 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  32.19 
 
 		 1003 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  39.34 
 
 		 203 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  31.11 
 
 		 151 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  34.45 
 
 		 215 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  34.82 
 
 		 179 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  36.89 
 
 		 315 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.1 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.2 
 
 		 263 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  35.83 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  33.87 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  31.51 
 
 		 219 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  42.06 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  35.64 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  33.87 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>