More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0114 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 		 449 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.91 
 
 		 745 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.17 
 
 		 309 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.51 
 
 		 1033 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.87 
 
 		 381 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 		 408 aa  85.9  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 340 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 		 567 aa  85.5  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.1 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  32.51 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.81 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  82  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.1 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.83 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.9 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.19 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  34.44 
 
 		 389 aa  79  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  32.1 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  36.95 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.56 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.5 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  30.89 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.16 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  33.49 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.94 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  32.31 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.66 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.63 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 		 576 aa  75.5  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.44 
 
 		 734 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.66 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.59 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  34.1 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 903 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2409  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.3 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  33.84 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  33.99 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  31.31 
 
 		 600 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 		 440 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  33.86 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  36.32 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.53 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.03 
 
 		 862 aa  71.6  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.02 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  33.17 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.12 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  29.79 
 
 		 706 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.12 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.16 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  36.02 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  34.9 
 
 		 1191 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.37 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.92 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.07 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  32.18 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  36.14 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  49.35 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  32.99 
 
 		 433 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  36.88 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  54.79 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  26.91 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0870  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 362 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.54 
 
 		 483 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  35.14 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  32.65 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.55 
 
 		 515 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>