More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0521 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 418 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  50.99 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  48.58 
 
 		 381 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  43.82 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.79 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  45.43 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  45.04 
 
 		 298 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  37.24 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  36.96 
 
 		 362 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 		 493 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  34.55 
 
 		 489 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  40.94 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  52.55 
 
 		 277 aa  97.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  36.92 
 
 		 313 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  37.32 
 
 		 250 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.52 
 
 		 184 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  51.75 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  51.75 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  43.45 
 
 		 517 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  41.61 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.3 
 
 		 734 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  45.89 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 		 576 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  48.7 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  43.21 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.47 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 		 291 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.68 
 
 		 320 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  49.17 
 
 		 176 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  49.17 
 
 		 176 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 		 291 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  46.96 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  34.69 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  45.65 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.89 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  41.78 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  47.14 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  58.14 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  49.25 
 
 		 1033 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  49.19 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  44.85 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  42.54 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  43.51 
 
 		 245 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  47.45 
 
 		 745 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  43.28 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 180 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 267 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  33.16 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  45.26 
 
 		 194 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  44.06 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  35.11 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  39.18 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  32.02 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  55.66 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  32.09 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  43.14 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  50.91 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  37.79 
 
 		 241 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.57 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  49.04 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  44.74 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  40.52 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  25.12 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  31.79 
 
 		 949 aa  78.2  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  35 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  47.45 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  44.52 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  45.05 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  39.56 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  45.05 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.37 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  48.03 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  45.05 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  40.97 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  35.35 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  46.73 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.57 
 
 		 903 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  41.9 
 
 		 524 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  45.05 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  44.55 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  53.33 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  40.44 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  45.6 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  40.3 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>