More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5950 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5950  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
289 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5479  hypothetical protein  59.57 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0226407  decreased coverage  0.00750026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  55.85 
 
 
273 aa  310  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  56.23 
 
 
273 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3099  pentapeptide repeat-containing protein  54.98 
 
 
284 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.240608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3394  pentapeptide repeats domain protein  55.85 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3381  pentapeptide repeats domain protein  55.85 
 
 
273 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3159  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  55.47 
 
 
273 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  55.09 
 
 
273 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  55.09 
 
 
273 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  54.34 
 
 
273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3741  pentapeptide repeat protein  55.72 
 
 
280 aa  279  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2300  pentapeptide repeat-containing protein  54.61 
 
 
345 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000752712  normal  0.0184634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4130  pentapeptide repeat-containing protein  54.96 
 
 
308 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.745162  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0057  pentapeptide repeat protein  50.35 
 
 
283 aa  255  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2406  pentapeptide repeat-containing protein  52.08 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584287  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  52.67 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07960  uncharacterized low-complexity protein  53.05 
 
 
286 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0731853  normal  0.339841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2555  pentapeptide repeat-containing protein  51.14 
 
 
290 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000219025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0691  hypothetical protein  49.44 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5548  pentapeptide repeat protein  51.15 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2170  pentapeptide repeat protein  50.17 
 
 
296 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4358  pentapeptide repeat-containing protein  43.77 
 
 
264 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3404  pentapeptide repeat-containing protein  65.52 
 
 
60 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.36 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  41.6 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  67.24 
 
 
1033 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  42.31 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2944  pentapeptide repeat-containing protein  45.56 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.281269  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  59.68 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  59.68 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  50.59 
 
 
411 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  47.62 
 
 
184 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  44.55 
 
 
433 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1862  hypothetical protein  41.76 
 
 
103 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.833098  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  48.84 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  55.71 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.25 
 
 
447 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
903 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  54.29 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  60.29 
 
 
277 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  44 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  48.24 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  52.86 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  48.24 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.74 
 
 
517 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.42 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.22 
 
 
489 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  41.75 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  64.91 
 
 
973 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  42.45 
 
 
389 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  60 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 
450 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  28.8 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  53.42 
 
 
156 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  58.33 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  37.86 
 
 
163 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 
900 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  45.56 
 
 
256 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  45.71 
 
 
225 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4620  pentapeptide repeat protein  51.9 
 
 
115 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  55.88 
 
 
225 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  65.45 
 
 
206 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  65.45 
 
 
206 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  38.83 
 
 
408 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  58.62 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.32 
 
 
446 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
361 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  56.9 
 
 
194 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  50.72 
 
 
152 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  52.05 
 
 
147 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0188  pentapeptide repeat-containing protein  48.72 
 
 
99 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  53.23 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  43.93 
 
 
179 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  40.22 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  57.14 
 
 
217 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 
824 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  43.62 
 
 
1807 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  49.23 
 
 
497 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  46.08 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  42.34 
 
 
180 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.59 
 
 
245 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.05 
 
 
222 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  55.93 
 
 
146 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  36.61 
 
 
237 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  43.4 
 
 
862 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.49 
 
 
340 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  56.45 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0950  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 
108 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  50.85 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0977  pentapeptide repeat protein  40.66 
 
 
108 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0814566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>