More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0997 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  93.56 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  66.18 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  53.36 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.5 
 
 		 312 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 361 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.1 
 
 		 381 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 		 408 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 381 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.61 
 
 		 449 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 489 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  32.46 
 
 		 416 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.19 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.9 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  34.59 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 		 710 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  34.9 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1260  pentapeptide repeat-containing protein  37.42 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  hitchhiker  0.00173599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.35 
 
 		 441 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.9 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.07 
 
 		 734 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.89 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.89 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.44 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.76 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.69 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.13 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.32 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.05 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  34.46 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  36.8 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  34 
 
 		 517 aa  72.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 		 515 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  34.84 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 		 576 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  32.51 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1033 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  31.47 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.26 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  34.57 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  32.84 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.56 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  32.18 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.65 
 
 		 776 aa  70.1  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.94 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.87 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  35.97 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  35.25 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 903 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  30.72 
 
 		 961 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  36.17 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  36.8 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  33.55 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  34.93 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.17 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  35.25 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  36 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  36 
 
 		 366 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.29 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  31.69 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.52 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  33.92 
 
 		 452 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  33.86 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  33.86 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.77 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  33.86 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  34.23 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  33.86 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  33.86 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 		 485 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  33.7 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  33.86 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  39.01 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.4 
 
 		 521 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  29.51 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>