More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1533 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1533  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  42.2 
 
 		 381 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  40.24 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.86 
 
 		 567 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.44 
 
 		 1033 aa  77.8  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  36.57 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 493 aa  75.9  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.28 
 
 		 286 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 		 309 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.1 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  38.85 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.78 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.83 
 
 		 234 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  35.96 
 
 		 706 aa  70.9  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.6 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.71 
 
 		 450 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  33.1 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  39.52 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.06 
 
 		 493 aa  68.6  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  32.14 
 
 		 600 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 		 517 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  44.23 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 		 340 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 		 681 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 		 401 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.02 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 		 260 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.98 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  35.61 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  33.06 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.42 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.41 
 
 		 521 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  43.43 
 
 		 446 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  40.62 
 
 		 360 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  40.62 
 
 		 360 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  40.62 
 
 		 360 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 524 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  38.6 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  45.19 
 
 		 267 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 291 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 710 aa  64.3  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  34.78 
 
 		 973 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  34.92 
 
 		 734 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  32.26 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  38.02 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.9 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  35.58 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  39.06 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  34.01 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  42 
 
 		 745 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  31.68 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  32.24 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.29 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  33.57 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  34.33 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 		 418 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 		 219 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  44.23 
 
 		 264 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  31.54 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 416 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  37.98 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  31.93 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 441 aa  61.6  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  37.61 
 
 		 354 aa  61.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  31.62 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  43.3 
 
 		 1901 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.62 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>