More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0344 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 360 aa  708    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  98.33 
 
 		 360 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  98.33 
 
 		 360 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  99.17 
 
 		 360 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  98.33 
 
 		 360 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  98.61 
 
 		 360 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 		 358 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  35.28 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  30.84 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  34.69 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  24.93 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.65 
 
 		 355 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  23.87 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 844 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.84 
 
 		 576 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.02 
 
 		 449 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 866 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 976 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.86 
 
 		 862 aa  89.4  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  24.1 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.32 
 
 		 846 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  27.46 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.3 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  31.07 
 
 		 880 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 877 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.61 
 
 		 880 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.59 
 
 		 567 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  34.98 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  28.69 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.68 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.75 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.15 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.24 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.24 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  29.22 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  31.82 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.58 
 
 		 949 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.17 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  25.89 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  27.07 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  25.95 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  31.15 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  19.58 
 
 		 607 aa  77.4  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  25.95 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  25.95 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  23.87 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 881 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  21.47 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  22.89 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  28.16 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 825 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  26.95 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 825 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 825 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  34.24 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  26.52 
 
 		 825 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  18.55 
 
 		 601 aa  74.3  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  26.33 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  27.56 
 
 		 929 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  27.06 
 
 		 710 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  26.39 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 		 872 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  26.11 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  28.03 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  26.28 
 
 		 886 aa  72.8  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.68 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  26.61 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1191 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  22.5 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  28.83 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  22.71 
 
 		 446 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.21 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.74 
 
 		 862 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.44 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.16 
 
 		 825 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  37.18 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.18 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.17 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.17 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  24.64 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>