More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2141 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2141  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  34.26 
 
 		 312 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 452 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.47 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.47 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  34.81 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.05 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 576 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.16 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  34.41 
 
 		 433 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  35.85 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.84 
 
 		 973 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 		 1033 aa  78.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.54 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  34.39 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.52 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 		 418 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  30.24 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.88 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  37.2 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.04 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0869  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0841759  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  31.58 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  37.09 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.48 
 
 		 734 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.43 
 
 		 521 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 		 489 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.41 
 
 		 343 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  32.24 
 
 		 961 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.07 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  31.38 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  33.15 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  34.75 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.13 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  33.56 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  33.56 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.22 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.21 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.9 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2559  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  33.88 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  32.58 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  32.02 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 441 aa  68.9  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 862 aa  68.6  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  28.78 
 
 		 420 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1191 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  34.44 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  35.57 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.84 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  31.86 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.21 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  36.08 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  31.95 
 
 		 1003 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  31.91 
 
 		 447 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  33.53 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 320 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.02 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 14916 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0921  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17771  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114465  normal  0.674203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.45 
 
 		 440 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  38.26 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  32.64 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.91 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.84 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5902  hypothetical protein  34.08 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 		 446 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  32.56 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 727 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 		 386 aa  65.1  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.5 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>