More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1198 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  100 
 
 
291 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  99.66 
 
 
291 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  98.63 
 
 
291 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  97.59 
 
 
291 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1047  secreted effector protein  96.56 
 
 
291 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.33 
 
 
350 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.96 
 
 
366 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  32.85 
 
 
366 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  32.85 
 
 
366 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  33.21 
 
 
366 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  38.13 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 
418 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0631  pentapeptide repeat protein  41.38 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.52 
 
 
576 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.58 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 
449 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 
493 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  37.59 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  35.76 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  39.82 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  34.52 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  34.92 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  40.98 
 
 
862 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.82 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.34 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 
1033 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
369 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  35.66 
 
 
900 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  31.79 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  43 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 
521 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.18 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  36.88 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.33 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  36 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  34.85 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.68 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  49.38 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  39.66 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  39.66 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  38.18 
 
 
217 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.2 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.94 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.22 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 
493 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  38.83 
 
 
524 aa  65.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  43.53 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.26 
 
 
311 aa  65.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  46.99 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  28.71 
 
 
514 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  41.94 
 
 
446 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  37.25 
 
 
361 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.6 
 
 
416 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  32.21 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  35.1 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  42.7 
 
 
734 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.17 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  39.84 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  43.18 
 
 
357 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 
903 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  35.59 
 
 
745 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.92 
 
 
184 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.17 
 
 
433 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.94 
 
 
600 aa  63.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  42.39 
 
 
130 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.31 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
331 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.87 
 
 
389 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 
320 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 
340 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  38.02 
 
 
215 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  34.51 
 
 
277 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
213 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 
194 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  36.44 
 
 
256 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1548  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 
172 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  44.58 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 
222 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  40.19 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
489 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
441 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.69 
 
 
386 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2937  pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 
195 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>