More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0207 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
247 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  82.59 
 
 
244 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  53.92 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  46.53 
 
 
824 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  51.69 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  52.38 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  46.88 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  43.36 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  40.46 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  50.62 
 
 
526 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
533 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  41.32 
 
 
493 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  47.73 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  55.56 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  47.19 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  47.19 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.16 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.67 
 
 
1033 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.87 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  41.12 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  37.01 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  45.74 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  40 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1117  pentapeptide repeat protein  48.28 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  45.35 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  50.55 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.31 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  45.71 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  51.76 
 
 
389 aa  65.1  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  42.22 
 
 
745 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  34.65 
 
 
312 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  44.58 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  44.58 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.09 
 
 
204 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  48 
 
 
514 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  44.58 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  50.59 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  44.58 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  50.59 
 
 
336 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  45.05 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 
880 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  53.62 
 
 
184 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  36 
 
 
880 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 
880 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  41.96 
 
 
877 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 
880 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  45.63 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.62 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  47.87 
 
 
351 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  58.21 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  53.33 
 
 
331 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  41.96 
 
 
880 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  45.33 
 
 
319 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  41.58 
 
 
189 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.17 
 
 
264 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  41.23 
 
 
401 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 
206 aa  62  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  42.53 
 
 
483 aa  62  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  41.23 
 
 
401 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.48 
 
 
381 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.18 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4190  pentapeptide repeat protein  51.28 
 
 
133 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  45.26 
 
 
386 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  48.89 
 
 
180 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  44.58 
 
 
122 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
1807 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  35.34 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  59.15 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
862 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
165 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1320  pentapeptide repeat-containing protein  48 
 
 
122 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  34.08 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 
489 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  43.48 
 
 
408 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  32.2 
 
 
681 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  55.26 
 
 
299 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 
175 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46 
 
 
517 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.92 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  45.88 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
446 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  50.75 
 
 
1831 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  39.58 
 
 
181 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  47.19 
 
 
222 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  44.68 
 
 
151 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  48.31 
 
 
343 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  41.12 
 
 
354 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  46.75 
 
 
354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  41.12 
 
 
354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>