More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3090 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  736    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  39.32 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  41 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.66 
 
 		 493 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 		 489 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  36.96 
 
 		 418 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  53.85 
 
 		 225 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  41.15 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  31.73 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.81 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  30.5 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  37.23 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  49.69 
 
 		 168 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  47.77 
 
 		 234 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  38.57 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  35.41 
 
 		 240 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  33.6 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  26.19 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  28.83 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  25.71 
 
 		 368 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  44.22 
 
 		 517 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  31.61 
 
 		 298 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.14 
 
 		 525 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  38.24 
 
 		 180 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.6 
 
 		 776 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.75 
 
 		 903 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.17 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.17 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.03 
 
 		 449 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  43.95 
 
 		 194 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  27.07 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  41.13 
 
 		 745 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  41.61 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  40 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.28 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.28 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  42.74 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  37.27 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  40.48 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  41.29 
 
 		 576 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  49.09 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  40.13 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  44.03 
 
 		 182 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.86 
 
 		 1033 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 		 176 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.24 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  46.96 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40.71 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.01 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  43.59 
 
 		 900 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  42.22 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1060  pentapeptide repeat-containing protein  39.86 
 
 		 157 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0113174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  40.15 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  40.46 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  36.79 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 		 567 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  41.96 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  41.48 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.31 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  37.21 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.44 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.88 
 
 		 214 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  40.67 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  39.61 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  45.31 
 
 		 165 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.29 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  39.1 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  35.92 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.41 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  41.04 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  24.91 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  44.07 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  44.07 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  34.62 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  34.62 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  32.88 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  36.87 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  39.53 
 
 		 734 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  38.51 
 
 		 266 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 		 203 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  36.49 
 
 		 179 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.1 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  31.51 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>