44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8946 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  715    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  49.72 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  35.94 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0442  hypothetical protein  27.9 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0029  hypothetical protein  29.06 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  30.66 
 
 		 485 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  31.05 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 368 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  26.06 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  24.91 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  42.55 
 
 		 521 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.27 
 
 		 945 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2150  hypothetical protein  29.17 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5019  pentapeptide repeat-containing protein  46.34 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8605  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101304  normal  0.331567 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  40.48 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3427  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  32.67 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  29.68 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  29.7 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.62 
 
 		 493 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  46.27 
 
 		 411 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1861  hypothetical protein  32.9 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.582955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  30.25 
 
 		 704 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  29.75 
 
 		 641 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  44.62 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  32.23 
 
 		 557 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  32.95 
 
 		 610 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  33.68 
 
 		 438 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2060  hypothetical protein  32.11 
 
 		 727 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.697893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  34.31 
 
 		 647 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  30.28 
 
 		 664 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6675  hypothetical protein  28.24 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00251998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.43 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 489 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  35.87 
 
 		 646 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  32.03 
 
 		 475 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  25.93 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  31.65 
 
 		 731 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  32.5 
 
 		 732 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6336  pentapeptide repeat-containing protein  25.44 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>