16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3674 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3674  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  908    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0475298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  22.44 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1689  hypothetical protein  24.06 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0269  hypothetical protein  20.91 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2426  hypothetical protein  22.06 
 
 		 704 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0317819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  33.68 
 
 		 351 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0126  hypothetical protein  21.98 
 
 		 610 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00047965  normal  0.915629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  22.6 
 
 		 731 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  23.29 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  21.99 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  25.55 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  22.49 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  22.83 
 
 		 732 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  26.92 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  23.68 
 
 		 327 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>