214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2879 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  100 
 
 		 327 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  80.94 
 
 		 326 aa  551  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  77.68 
 
 		 327 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  78.29 
 
 		 327 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  69.06 
 
 		 330 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3027  Ion transport 2 domain protein  27.43 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 441 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1183  Ion transport 2 domain protein  33.03 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.993846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.52 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.57 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.54 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0112  heat shock protein DnaJ domain protein  38.37 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0108  heat shock protein DnaJ domain protein  38.37 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.8375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  26.06 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.14 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  37.04 
 
 		 537 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.53 
 
 		 525 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 		 408 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.54 
 
 		 973 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1176  hypothetical protein  27.68 
 
 		 646 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  36.07 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  38.54 
 
 		 179 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.71 
 
 		 517 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.25 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 182 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  41.89 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  46.97 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 		 521 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.79 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  46.97 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  42.42 
 
 		 497 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 900 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0811  hypothetical protein  23.11 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.160858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.36 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 260 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  34.85 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 130 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 172 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0415  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  37.36 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.21 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  51.11 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  42.68 
 
 		 168 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.05 
 
 		 234 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  32.43 
 
 		 440 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 1033 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 202 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  37.96 
 
 		 182 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  36.36 
 
 		 745 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1915  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 		 149 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1941  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 		 149 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  37.78 
 
 		 190 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 161 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  37.36 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1807 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  40.95 
 
 		 526 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  39.76 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2772  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 129 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 		 176 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  37.04 
 
 		 223 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 		 176 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.85 
 
 		 381 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  29.09 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  32.04 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  31.91 
 
 		 734 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  34.09 
 
 		 237 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  38.55 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  25.61 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 		 449 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  44.29 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  30.4 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  35.44 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1320  Ion transport 2 domain protein  38.78 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.17 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0457  Ion transport 2 domain-containing protein  51.22 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  39.19 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  39.19 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  38.82 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  39.47 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  34.82 
 
 		 489 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 194 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  37.25 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.61 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  43.59 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>