37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2625 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  721    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  89.94 
 
 
172 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  86.71 
 
 
161 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0433  hypothetical protein  81.48 
 
 
81 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  46.1 
 
 
160 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  48.55 
 
 
143 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2325  hypothetical protein  70.89 
 
 
79 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2877  hypothetical protein  70.83 
 
 
79 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  43.88 
 
 
148 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  39.57 
 
 
141 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  38.13 
 
 
141 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  36.99 
 
 
143 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  35.81 
 
 
149 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  40 
 
 
141 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  38.84 
 
 
129 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  37.23 
 
 
154 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0306  Ion transport 2 domain-containing protein  37.41 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.408069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  31.33 
 
 
158 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0075  membrane protein, Kef-type K+ transport system NAD-binding component  31.07 
 
 
111 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  41.67 
 
 
202 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  36.26 
 
 
150 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
159 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  46.15 
 
 
142 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
132 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2879  uncharacterized low-complexity protein  29.25 
 
 
327 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  42.31 
 
 
142 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  27.46 
 
 
145 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  36.67 
 
 
149 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0810  ion transport 2 domain-containing protein  46.34 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  32.76 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1372  Ion transport 2 domain-containing protein  44.68 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  36.9 
 
 
157 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0938  Ion transport 2 domain-containing protein  41.46 
 
 
327 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167939  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0839  ion transport 2 domain-containing protein  45.95 
 
 
327 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0755  Ion transport 2 domain-containing protein  41.86 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8080  hypothetical protein  84 
 
 
100 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.363748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>