45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2273 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2273  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 
142 aa  287  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3367  Ion transport 2 domain-containing protein  68.57 
 
 
142 aa  207  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2797  Ion transport 2 domain-containing protein  43.61 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.663377 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5664  Ion transport 2 domain-containing protein  34.62 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1713  Ion transport protein  36.52 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0380308  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1737  hypothetical protein  42.17 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2914  Ion transport 2 domain-containing protein  36.25 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44180  voltage-dependent potassium channel  49.25 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0536818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3905  Ion transport 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1264  ion transport 2 domain protein  40.24 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.345942  normal  0.652381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2745  Ion transport 2 domain-containing protein  34.18 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2823  Ion transport 2 domain-containing protein  34.18 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4033  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0877  hypothetical protein  29.81 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1124  Ion transport 2 domain-containing protein  32.62 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759829  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1179  Ion transport 2  30.71 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00343894  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0435  Ion transport 2 domain-containing protein  45.28 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948908  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1961  Ion transport 2  31.76 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101403  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1749  Ion transport 2 domain-containing protein  26.12 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0607848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3124  ion transport 2 domain-containing protein  30.23 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2625  Ion transport 2 domain-containing protein  46.15 
 
 
361 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.803406  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3241  hypothetical protein  41.67 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0962  Ion transport 2 domain-containing protein  31.4 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.318129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3293  hypothetical protein  28.7 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5595  Kef-type K+ transport system-like protein  42.11 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734625  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3025  Ion transport 2 domain-containing protein  31.11 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.463861  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2650  Ion transport 2 domain-containing protein  28.46 
 
 
202 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4979  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4596  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0468  Ion transport 2 domain-containing protein  39.29 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.370968  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4684  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0831777  normal  0.858819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1358  hypothetical protein  26.9 
 
 
170 aa  48.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.250908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1691  K+ channel, pore region  29.03 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.758167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1665  hypothetical protein  29.81 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0983304  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2458  Ion transport 2 domain-containing protein  27.83 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128962  normal  0.806826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1493  Ion transport 2  32.56 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0395  membrane protein related to Kef-type K+ transport system NAD-binding component  36.67 
 
 
158 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.855451  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0591  hypothetical protein  30.28 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  44.9 
 
 
222 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1278  hypothetical protein  25.38 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4133  hypothetical protein  27.17 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  28.93 
 
 
262 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  31.48 
 
 
211 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  29.73 
 
 
231 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1933  hypothetical protein  29.31 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.162847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>